1月13日的《RekInchangDaily》对9篇文献进行了分析，重点关注饮食与细菌的相互作用、新陈代谢、细胞替代、肠道发育、肠道干细胞、肠内分泌细胞、细菌发育和益生菌。
Nature子刊分析1000多人的菌群、饮食和新陈代谢之间的关系
天然药物——[3613]
肠道菌群与特定营养素、食物类型和饮食模式密切相关，健康的植物性食物尤其影响肠道菌群的组成。大量与饮食/健康相关的微生物尚未被表征。肥胖相关菌群标志物，粪便普氏菌和芽囊菌与较好的餐后糖代谢相关，整体菌群组成可以预测一系列空腹和餐后心脏代谢指标。一组与健康和心脏代谢健康相关的30种微生物标记和细菌种类可以区分无症状个体的心脏代谢健康和整体饮食健康。
[编者评]
肠道菌群受饮食调节，可以影响宿主的代谢健康。这三者之间存在着非常复杂的关系。最近发表在《自然医学》杂志上的一项新研究分析了来自英国和美国两个队列的1,098人，以更深入地研究肠道菌群特征、心脏代谢和饮食习惯之间的关系。这值得专家们认真研究。
【原始信息】
1,098名深度表型个体的微生物组与宿主代谢和习惯饮食的关联。
2021-01-11，doi:101038/s41591-020-01183-8
Nature子刊有趣的数据！人体每天更换多少细胞和细菌？
天然药物——[3613]
评估人体内各类细胞的更新情况。人体内每天更换的细胞总数约为3300200亿个，其中血细胞86个，其余主要是胃肠道上皮细胞。人体每天更换的细胞总量约为8020g，其中血细胞和胃肠上皮细胞各占40%左右。脂肪细胞和肌肉细胞占人体总细胞量的75%，但虽然更新缓慢，但只占每日细胞周转的5%主要是肠道菌群，人体的总数和总质量每天更换的细菌大约有10到400万亿个、60到2000克。
[编者评]
本周《自然医学》发表的一项有趣的研究评估了成人不同类型细胞的更新率，发现胃肠道细胞的更新率在数量和质量上都很重要，并且每天更换的肠道细菌的质量可能是也和肠道细菌的数量有关，估计比这个还要大。人体细胞每天都在更新。
【原始信息】
人体内细胞更新的分布
2021-01-11，doi:101038/s41591-020-01182-9
细胞绘制人类肠道发育的时空图。
细胞——[38637]
使用scRNA-seq和空间转录组描述肠道形态发生过程，并识别101个细胞状态和关键形态发生里程碑，例如上皮和间充质祖细胞群。解释隐窝-绒毛轴行程的原理，肠道发育中神经、血液、血管、间质和免疫细胞群的形态发生，发育中成纤维细胞和肌成纤维细胞亚型分化水平的测定，干细胞、血管系统和肠道相关淋巴组织中的成纤维细胞具有功能多样性，通过构建形态梯度模型来解释这一点。确定细胞分化的顺序，并确定哪些细胞和位置与罕见的发育性肠病有关。
[编者评]
Cell最近发表的一篇论文利用单细胞RNA测序和空间转录组学绘制了人类肠道形态发生的时间和空间转录图谱，阐明了隐窝绒毛轴形成以及神经、血管和间充质形态发生的原理。发育中的肠道中的免疫细胞群。为了方便进一步的研究工作，建立了开放的在线资源——胎儿肠道发育的时空分析。
【原始信息】
单细胞分辨率人类肠道发育的时空分析
2021-01-05,doi:101016/jcell202012016
中国药科大学压力损害肠道，饮食与肠道细菌相互作用有何作用？
自然通讯——[12121]
普通饲料和精饲料对慢性束缚应激小鼠肠上皮损伤、菌群变化、肠道干细胞功能障碍等有不同的影响。机械上，富含CD的棉子糖可以维持罗伊氏乳杆菌的生长，通过将棉子糖代谢为果糖来促进糖酵解，并为ISC增殖提供能量，有利于维持ISC向前）形成代谢循环。
[编者评]
饮食和心理社会因素可能会影响肠道菌群和人类健康，但饮食和压力对肠道菌群和肠道健康的影响尚未研究。中国药科大学郝海平、郑晓和研究小组在《自然通讯》上发表的一项新研究发现，膳食棉子糖和罗伊氏乳杆菌可以形成连接饮食、精神压力和肠道的代谢前馈回路。改善精神压力造成的肠道损伤的新研发思路。
【原始信息】
饮食-微生物代谢前馈回路调节应激肠道中的肠道干细胞再生。
2021-01-11，doi:101038/s41467-020-20673-4
Nature发表论文发现可直接分化为肠内分泌细胞和潘氏细胞的肠道干细胞
自然细胞生物学——[20042]
非典型Wnt/PCP激活的肠道干细胞倾向于分化为肠内分泌细胞或潘氏细胞谱系，并且这种ISC亚群不会经历先前假设的良性或多能过渡状态，而是经历单能过渡状态。直接分化为EEC和PC的分泌状态。祖细胞，成熟为PC的单能过渡细胞处于休眠状态，表达干细胞和分泌细胞谱系基因，这些细胞是先前报道的Lgr5+标记细胞，Wnt/PCP激活的Lgr5+ISC与Wnt/起作用。-Catenin激活的Lgr5+ISC在转录水平上没有表现出显着差异，表明两个谱系之间的分化命运差异发生在转录后水平。
[编者评]
经典的Wnt//-连环蛋白通路是维持Lgr5+ISC所必需的，而非典型的Wnt/PCP通路共享一些信号通路成分，并且这两条通路相互拮抗。那么，Wnt/PCP信号传导是否参与调节ISC异质性和谱系决定？最近发表在《自然细胞生物学》上的一篇文章揭示，非典型Wnt/PCP激活的ISC可以直接分化为肠内分泌细胞或潘氏细胞谱系，绕过了之前假设的双能或多能分泌祖细胞状态。虽然Wnt/PCP激活的Lgr5+ISCs和Wnt/-catenin激活的Lgr5+ISCs在转录水平上没有显着差异，但这表明两者之间谱系分化的差异主要源于不同的分化命运。转录后水平。
【原始信息】
非经典Wnt/PCP信号传导调节肠道干细胞谱系，引发肠内分泌和潘氏细胞命运
2021-01-04,doi:101038/s41556-020-00617-2
国内团队CREPT调节肠道干细胞
自然通讯——[12121]
促蛋白CREPT在小鼠肠隐窝中表达。敲除CREPT会降低正常情况下肠干细胞增殖和分化相关基因的表达，从而导致肠上皮细胞增殖和肠道X射线的影响。在肠道再生过程中，CREPT促进ISC核内-catenin的积累并激活Wnt信号，因此CREPT是ISC维持所必需的。
[编者评]
清华大学常志杰、王银银、北京大学人民医院叶雄军及其研究团队在《NatureCommunications》上发表最新研究，揭示了促蛋白CREPT在小鼠肠道干细胞中的关键作用。
【原始信息】
CREPT是肠道再生过程中大鼠干细胞维持所必需的。
2021-01-11，doi:101038/s41467-020-20636-9
Nature子出版物乙酰胆碱可能调节肠内分泌细胞的分化
自然通讯——[12121]
乙酰胆碱是肠道神经递质，作用于肠上皮蕈碱Gq偶联受体如M3R，调节肠上皮分泌和免疫功能。良性簇状细胞与胆碱能阻断可减少Lgr5+肠道干细胞Prox1+内分泌细胞感知胆碱能阻断而诱导簇状细胞扩张，簇状细胞向肠内分化为分泌型，粘膜乙酰胆碱水平升高，PI3K维持急性辐射损伤导致这种代偿机制消失，簇细胞和乙酰胆碱产生减少。
[编者评]
肠道神经递质乙酰胆碱调节重要的肠上皮分泌和免疫功能，但其对肠道干细胞功能和分化的影响尚不清楚。最近发表在《NatureCommunications》上的一篇文章发现，阻断乙酰胆碱信号传导可诱导Lgr5+肠干细胞减少、根尖周细胞选择性扩张和内分泌细胞分化、粘膜乙酰胆碱水平增加并维持PI3K信号传导。我们表明，肠分泌束细胞对于胆碱能肠道生态位变化后维持上皮稳态很重要。
【原始信息】
Prox1阳性细胞监测并维持小鼠肠上皮胆碱能生态位。
2020-01-08,doi:101038/s41467-019-13850-7
张和平、魏红等幼儿期环境暴露影响肠道菌群发育
肠道微生物——[774]
将无菌小鼠暴露于草原、森林、沙漠土壤环境60天，然后部分转移至两种不同环境中采集粪便样本；小鼠肠道内可成功建立多种环境类型的土壤菌群。不同土壤中小鼠肠道菌群的定植、组成和功能存在显着差异。肠道初始定植
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