鸡毛肠可分为败血型、毛肠型、慢型、热型四种。脓症和脓症类型在雏鸡中更为常见，导致严重的发病率和死亡率，高达50-80%。慢性和隐性形式多见于成年鸡，通常无明显临床症状，死亡率较低。比率。
雏鸡症状较明显，病雏精疲力竭，翅膀下垂，昏昏欲睡，怕冷，挤在一起尖叫，病雏没有食欲或饥饿。嗉囊空虚或充满气体，排出水样、白色、糊状稀便，稀便粘在肛门周围的绒毛上，引起肛门突出、伸展或收缩。呼吸困难、伸长脖子、张开嘴。
一旦成虫患病，它们通常不会出现临床症状，而是成为潜伏携带者，母鸡产蛋量减少，未受精和死亡的发芽蛋数量增加。少数严重感染的鸡还可能出现一些急性或慢性症状，甚至可能出现败血症而死亡。病鸡表现全身无力，体重进行性下降，精神抑郁，羽毛松弛，翅下垂，食欲不振，贫血，鸡冠、胡须苍白，有时腹泻，排出绿色或绿棕色稀便。这可能会导致生产大幅减少甚至完全停止。
病鸡尸检显示，主要病变为肝脏呈红色肿大、胆囊肿大、脾脏肿大、腹膜软性炎症、腹腔内脏表面纤维素性渗出物、腹膜炎症等。内容物该物质呈浅黄白色，质地类似豆腐渣，肺、肝、心脏、盲肠、大肠、砂囊表面有灰白色小坏死点。或者，经常形成小结节，这是鸡白痢的特征变。
产蛋鸡的病变主要发生在卵巢，卵巢被拉伸，有的出现水泡，卵泡颜色暗淡，呈淡蓝色或深紫色，内容物油腻或干酪状，周围有厚厚的囊膜。管子可能会收缩，从而完全停止母鸡的生产。公鸡病变主要出现在睾丸和输精管，一侧或两侧睾丸肿大或萎缩，睾丸组织内有数个小坏死病灶，输精管肿大并有渗出物。
病鸡常发生心包炎，心包液增多、混浊，肝脏常肿大变脆，有时破裂，引起严重内出血，有的病鸡死亡。
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