上的水泡很可能是生殖器疱疹引起的，生殖器疱疹主要是由人类单纯疱疹病2型引起的。可采用全身药物治疗，包括抗病药物、镇痛药物和外用药物。抗病药物常用的有阿昔洛韦、泛昔洛韦或伐昔洛韦，一般是口服治疗，疗程由医生决定。
如果是复发患者，可以在症状刚出现后24小时内服药。如果经常复发，可以长期服用，对症治疗。一般用阿司匹林、布洛芬等来缓解疱疹带来的疼痛和不适。局部治疗可加入外用软膏或清洁药物，如阿昔洛韦霜、喷昔洛韦霜等。生理盐水、硼酸、稀释高锰酸钾、稀释碘伏溶液等。可用于清洁，对皮肤黏膜刺激较小。如果有继发性细菌或真菌感染，也可以使用抗生素或抗真菌外用软膏。