这条蛇的皮肤上覆盖着鳞片。每一片鳞片都是皮肤较厚的部分，一层柔软的皮肤将它们分隔在鳞片之间的缝隙中，这使得蛇的身体非常灵活。背部的鳞片是最显眼的部分。这些鳞片呈圆形或尖形，边缘重叠，就像屋顶上的瓦片。鳞片可能是光滑的或粗糙的脊状。
有些种类的鳞片是颗粒状或水滴状，鳞片之间互不重叠。背上鳞片的数量、形状、排列和颜色都非常有助于区分不同种类的蛇。大多数种类的蛇都有宽大的腹鳞，排成一行。尾巴下部的鳞片也是单排或成对排列。在完全水生的物种中，腹侧和尾侧所覆盖的鳞片逐渐演化成狭窄的形状，最后成为脊状或骨脊状的鳞片带，覆盖整个身体的下部。
最原始的蛇没有明显的腹部鳞片。一些覆盖头部的鳞片小而呈颗粒状，但在大多数情况下，鳞片大而呈盘状。蟒蛇、蟒蛇和蝰蛇头上的鳞片较小——尽管这些科的一些物种头上的鳞片较大。其他种类的蛇头上有中等大小的鳞片。相反，眼镜蛇和两栖类的头鳞较大，但也有例外。
因为蛇没有眼睑，所以它们的眼睛被一个很大的圆形鳞片保护着，这个鳞片叫做透明膜。这种鳞片也会随着身体其他部位的皮肤周期性脱落。蛇在地表行走时，鳞片可以防止身体磨损，水分流失。此外，皮肤中的色素细胞使得各种蛇都有其独特的颜色和斑点。
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