由科学指南针-唯理盘算和济南庚子盘算配合举行 的 “第五届固体与外貌盘算培训中级班(外貌偏向)” 将于2021年10月22日-24日在北京举行 。
本次培训是线下课程,没有线上直播;
提供全彩色打印课本;
允许录音不行录像;
操作部门有视频回放;
本次培训不是针对零基础的,对于盘算基础部门会一代而过,请没有基础的同砚 先加入低级培训班。
课程内容第一部门 第一性原理盘算(低级班)快速回首DFT+U设置与线性响应法拟合U值,HSE杂化泛函设置,vdW校正设置DFT-D和vdW-DF,泛函对吸附能影响,RPA的设置要领,RPA准确 盘算外貌吸附能。磁性系统 的设置技巧,NPAR/KPAR提升盘算速率 的技巧,CPU和GPU加速版本VASP的编译和使用,VASP的种种插件的编译(VTST,OPTCELL,VASPSOL,NBO/SSADNDP,Wannier等)。
第二部门 电子结构剖析态密度和能带形成的基本理论,案例剖析 (单原子催化剂,外貌离子缺陷态,外貌态,d带中央 ,催化吸附的轨道相互作用模子 ),态密度盘算要领,p4vasp 和 VASPKIT 后处置赏罚 剖析 ,态密度的积分,pymatgen 自动画态密度图,K点选取和 ISMEAR对态密度盘算影响,DOSCAR详解,过渡金属的d带中央 理论,N2分子和外貌团簇催化剂的轨道相互作用模子 剖析 。轨道相互作用基础知识,载体和吸附分子态密度作用剖析 ,CO/Ni,N2/Fe3催化剂的轨道相互作用模子 剖析 。
电荷密度和原子电荷CHCGAR等格点文件名堂 ,自旋电荷密度剖析 ,VESTA 作等值面图,二维切面图。VASPKIT处置赏罚 电荷密度文件,电荷密度差分,分子 CO,N2吸附前后的电荷密度差,石墨烯插锂前后的电荷密度差;变形电荷密度;外场下的电荷密度差;平面平均的电荷密度差。Partial charge density 盘算要领流程,实空间波函数提取,提取分子轨道图,绘制 VBM 和 CBM 的电荷密度/波函数,绘制缺陷态/隙间态的电荷密度/波函数,研究引发电子的漫衍,STM盘算和 Partial Charge Density 对应关系,STM “针尖偏压” 和 “恒定高度”模拟。Bader电荷盘算, AIM(atom-in-molecule)电荷划分要领,凭证 原子电荷着色的结构图。
ELF、静电势和功函静电势
功函数看法和盘算要领,异质结静电势,静电势剖析 外貌负载团簇的电子流向,分子外貌或载体外貌静电势漫衍,受阻路易斯酸碱对。电子定域化函数(ELF),ELF 研究外貌催化反映过渡态、电子化合物、缺陷态、分子团簇、吸附分子。
COOP、COHP
晶体轨道重叠布居 COOP 和晶体轨道哈密顿布居 COHP 基本原理,文献案例:单原子催化模子 /电催化模子 /高压质料/磁性子 料/镧硼新质料等COHP剖析 。Lobster盘算COOP和 COHP,Wxdragon使用,盘算 COHP的注重 事项,lobsterin 输入文件,投影到基组的类型,Spilling 误差,指定原子对,指定距离规模,高斯展宽,打印 Mulliken and Löwdin 电荷,Lobster 盘算重启,输出轨道的实空间轨道(PAW 或 LCAO)数据。Lobster 盘算实例:金刚石,CO/Ni,伶仃 CO 分子。
periodic NBO、SSAdNDP
电子定域化要领简介 NBO 和 Periodic NBO 概述,NBO 和 Periodic NBO 法式先容 ,提取单中央 ,双中央 的 NBO。NPA (Natural Population Analysis) 电荷,Periodic NBO 法式编译,投影法式的编译 projection.exe,basis.inp高斯基组文件准备,平面波基组到高斯基组的投影要领,EMSL基组库使用。实例:晶体Si的NBO盘算, NBO轨道绘制和 NBO盘算效果 剖析 。实例: CO/Ni(100) 吸附模子 的NBO剖析 。AdNDP,NBO要领的局限性,多中央 化学键,AdNDP盘算流程,ssAdNDP 编译,ssAdNDP应用实例 2D Borphene,2D 硼金属质料,Be5C2,Cu2Si,ssAdNDP 的搜索技巧,原文还原:硼墨烯的多中央 键研究。
第三部门 CP2K与重新算分子动力学CP2K 编译/tools/toolchain要领,预编译版本。
CP2K经典文章先容 ,CP2K的使用,CP2K 输入文件,.inp 文件名堂 ,CP2K盘算原理和主要 要害词详解,CP2K输出文件,CP2K基组,赝势,坐标读入,基组重叠误差,OT 和 Diag 对比,结构优化和实例训练 ,Cu(111) + 46H2O 结构优化与 AIMD,建设固液界面模子 要领,重大 催化系统 外貌的优化。DFT+U,杂化泛函,磁性排列,范德华校正等参数的设置。
VASP与CP2K重新算分子动力学模拟:AIMD 盘算基本流程,相空间,系综,宏观量的盘算,牛顿运动方程,速率 形式的 Verlet 算法,AIMD模拟的要害参数,AIMD模拟时间步长的选择,AIMD 模拟参数测试,AIMD 的重复性问题,Energy drift 问题,周期性界线 条件,动能与温度,控温手艺 与热浴,速率 调治法,Anderson 热浴,Nosé–Hoover 热浴,模拟退火, AIMD 的盘算参数详解。轨迹文件的简化和可视化,VMD 的简朴使用,AIMD 的后处置赏罚 ,键长键角跟踪,能量与温度涨落,径向漫衍函数,亥姆霍兹自由能路径盘算,均方位移,扩散常数,速率 自相关函数,红外光谱,固液界面平均静电势盘算,引入电极电势对固液界面的影响。锂离子电池的动力学模拟。
自由度限制的AIMD:Potential of mean force,blue-moon/Slow-growth 要领盘算自由能势能面。Metadynamics 要领。高斯势函数的参数技巧,数据后处置赏罚 ,一维二维自由能势能面绘制要领。
第四部门 外貌催化反映热力学和动力学外貌热力学
原子群集 方式,FCC、HCP、BCC,Miller 指数,高 miller 指数晶面与台阶面,外貌弛豫与重构,对称和非对称的 slab 模子 ,外貌能盘算,金属外貌能和功函数据库,原子坐标牢靠 ,纳米颗粒的结构和外貌能关系,Wulff construction 构建,纳米催化中的晶面效应。吸附类型(化学吸附、物理吸附、解离吸附),吸附能盘算,吸附位点,吸附盘算注重 事项,吸附物种间的相互作用,笼罩度,平均吸附能。化学平衡,外貌吸附平衡,Langmuir 吸附等温式与条件 假设,熵变对吸附的影响,笼罩度和温度/压力/吸附能关系盘算,多组分气体吸附平衡,催化剂中毒微观原理,外貌化学势的盘算与外貌热稳固 性盘算,催化剂中毒常见案例。外貌催化热力学盘算研究思绪 。外貌缺陷态的稳固 性。
过渡态搜索
过渡态判据,无过渡态反映类型,寻找过渡态要领综述,chain-of-states 搜索要领和原理,传统 PEB 要领(plainelastic band)要领遇到的问题,NEB 中 nudge 历程原理,Climbing Image 原理,判断插点个数,插点要领,判断插点合理性,CINEB 的 INCAR 要害词和盘算要领,VTST 优化算法剖析 ,nebresults.pl,nebbarrier.pl, nebspline.pl, nebef.pl 等 VTST 剧本 ,neb.dat、spline.dat、exts.dat、mep.eps 文件自动判断NEB路径上的极值点,Dimer 要领原理,选择 Dimer,平移 Dimer 历程,Dimer 生长历史,Dimer 的 INCAR 要害词和盘算要领, MODECAR 天生 ,DIMCAR、CENTCAR 和 NEWMODECAR 解读,天生 DIMER 偏向 movie 预判过渡态盘算是否乐成,VTST 过渡态盘算收敛判断,过渡态搜索常见问题息争决方案。扩散系数与离子电导盘算。NEB+Dimer 高效搜索过渡态。NEB 盘算线性插点的问题,IDPP 插点原理,使用 pymatgen-diffusion 和 pymatgen 做 IDPP 非线型插点。
频率盘算与热力学数据盘算
Hessian 矩阵,力常数矩阵对角化,伶仃和吸附分子振动区别,零点振动能,有限位移频率盘算,Jmol 视察振动,振动数据提取和剖析 。系综配分函数,分子配分函数,热力学量与配分函数的关系,内能、亥姆霍兹自由能、焓、吉布斯自由能、熵、等容热容、等压热容,理想气体假设,能量因素 的拆分,平动、转动、振动、电子跃迁的配分函数,和其对种种热力学量的孝顺 盘算,振动频率、温度和熵的关系,0K 热力学数据校正盘算,现实 温度热力学数据校正盘算,VASPKIT 盘算吸附分子热力学量,吸附分子和伶仃分子的热力学量盘算区别。气体分子的自由能校正,查实验数据热力学表 JANAF-NIST,VASPKIT盘算伶仃分子热力学量。
化学反映速率常数盘算
基元反映,单分子多分子基元反映速率方程,稳态平衡和速率方程关系,反映速率常数盘算,Arrhenius equation,eyring equation,指前因子盘算,表观活化能拟合,过渡态理论,准平衡态假设,过渡态络合物,透热系数,Recrossing 问题,判断基元反映是否容易发生,Eyring 过渡态理论的局限性,ΔGa/温度/反映速率常数 k 之间的关系,半衰期,谐振过渡态理论 HTST 公式,吸赞许 脱附步骤反映速率,Knudsen-Langmuir equation,隧穿效应,Wigner 要领盘算透热系数。
催化反映机理
Langmuir-Hinshelwood (LH) mechanism,Eley-Rideal (ER) mechanism,Mars-Van Krevelen (MvK) mechanism,及其速率方程组。LH 实例合成氨反映,ER 实例Volmer-Heyrovsky HER,MvK 实例低温 CO 氧化反映。催化循环和总包反映能量。
微观动力学模拟简介
TOF(Turnover frequency),TON(Turnover number),微观动力学模拟,稳态近似,平均场近似,联立和求解微分方程组,CatMap 的使用,CatMap 输入文件,形成能的盘算,shomate_gas,绘制速率-温度/压力争 ,输出笼罩度图,提取自由能势能面,绘制吸附能火山曲线,界说 linear scaling,拟合 BEP 关系线。决速步和决速态理论决速步,决速步理论推导出剖析 的 TOF 的表达式,温度/分压对 TOF 影响,k 表象,E 表象,决速态,TOF-determiningtransition state (TDTS),TOF-determining intermediate (TDI)。
BEP 和火山曲线
BEP 关系,甲烷 C-H 活化/NO 剖析等催化反映中的 BEP 关系,BEP 关系注重 事项,截距和斜率纪律。BEP 关系最新拓展:配位数,d 带中央 ,态密度,费米能级,电离能,功函等等的线性纪律。
高通量盘算与机械学习
Materials project 数据库API使用和批量获取结构要领。Pymatgen 简介,自动化外貌切割,自动天生 外貌吸附结构,自动绘制能带结构,态密度图,稳固 性相图。
第四部门 电催化盘算(VASPsol与JDFTx)盘算电催化基础:ORR、OER、HER、CO2RR、NRR反映机理,CHE模子 盘算台阶图,盘算过电势,pH值校正,电催化分子自由能校正,基元步骤自由能,OER 实例,光催化基础,Band Edge位置盘算。
进阶电催化盘算:传统盘算模子 缺陷,“双电层”理论,Gouy-Chapman 模子 ,零电荷电势 potential of zerocharge (PZC),显式/隐式溶剂模子 门户 和代表文献,一连 介质模子 ,VASPsol 使用要领和实例训练 ,VASPsol的恒电势盘算。
JDFTx 编译安装,JDFTx 学习要领,JDFTx 输入输出文件结构,单点能盘算 .in 文件,几何优化.in文件,频率盘算 .in文件,CANDLE溶剂化模子 ,外貌模子 盘算+溶剂化+电极电势盘算,charge-neutral method vs constant-potential method,配合JDFTx恒电势准确 盘算电催化模子 常用要领。溶剂和电极电势对二维质料电催化的影响。显式溶剂模子 +AIMD处置赏罚 电催化界面要领(AIMD部门解说)
讲师先容
刘博士,清华大学博士,恒久从事外貌催化和质料盘算研究,对量化盘算,第一性原理盘算,分子动力学模拟有六年研究履历 ,醒目 VASP,CP2K,Gaussian,ORCA 熟练使用 JDFTx,Gromacs,ADF 等盘算法式。近三年在外貌催化,电催化,电池质料,过渡金属配合物等领域揭晓 多篇文章。在 JACS,Nat. Commun. ,ACS Catal.,Nano Energy, Natl. Sci. Rev. 等期刊上以第一作者揭晓 纯理论盘算文章,并与实验科学家相助在 Nat. Nanotech., Nat. Commun., PNAS,Adv. Mater., JACS 等期刊上揭晓 多篇相助文章。
培训时间所在报道时间:
2021年10月21日,晚上7:00-9:00
2021年10月22日,上午8:30-9:30
报到所在为冠京饭馆一层大厅。报到时将提供课本、约请 函、发票等。
培训时间:
2021年10月22日-24日共三天,上午9:30-12:30;下战书 2:00-6:00
所在:
北京市丰台区冠京饭馆
报名费自费价:2400元
公费价(提供发票和聚会会议约请 函):2800元
用度包罗全三天的听课费、全彩课本、电子资料、部门操作视频回放、答疑。不能到现场加入的学员提供课本邮寄、课程录音、和其他课程资料。
报名方式欲加入本次培训者请点击阅读原文下载报名表报名,填写完整后发送至:
gengzijisuan@163.com
或者直接在浏览器输入:
(gengzicompute.com/baomingbiao.xlsx)
其他问题添加客服微信:
培训须知1. 每位报名学员在报到时将会收到提供盖有公章的纸质聚会会议通知。若当前聚会会议通知不利便 报销,我们也可凭证 报名者的要求举行 调整,请通过微信联系我们。
2. 如学员报名后,因特殊情形 未能顺遂 乐成联系报名学员者那么本次报名将视为作废,且后期报名将不再接受报名受理。我们希望报名培训课程学员是至心 加入学习,请只管 阻止 铺张 有限的培训名额。3. 培训内容包罗大量训练 和演示,故强烈建议加入者携带条记本电脑,并注重 充电。4. 具备一定的第一性原理知识*本次中级班课程内容的原创 ppt详细包罗了课上细节内容,以纸质版课本的形式发给学员,亦可课后作为资料书使用,不提供电子版,不得以任何形式撒播 给他人。